Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Trappc6bQ9D289 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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