Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc167Q9D162 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms