Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lsm12Q9D0R8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms