Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Shmt2Q9CZN7 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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