Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RpainQ9CWY9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RpainQ9CWY9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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