Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cdca4Q9CWM2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms