Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccer1Q9CQL2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms