Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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