Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chmp3Q9CQ10 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Chmp3Q9CQ10 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Chmp3Q9CQ10 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Chmp3Q9CQ10 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Chmp3Q9CQ10 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Chmp3Q9CQ10 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms