Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms