Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim26Q99PN3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms