Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd1Q99MV1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms