Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms