Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tlr3Q99MB1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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