Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pagr1aQ99L02 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pagr1aQ99L02 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms