Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Def8Q99J78 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Def8Q99J78 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Def8Q99J78 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Def8Q99J78 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Def8Q99J78 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Def8Q99J78 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Def8Q99J78 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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