Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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Rnf144aQ925F3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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