Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms