Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf6Q91YR7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf6Q91YR7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms