Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atl3Q91YH5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atl3Q91YH5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms