Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU1

Yipf1, Protein YIPF1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf1Q91VU1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Yipf1Q91VU1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms