Protein–RNA interactions for Protein: Q8K327

Champ1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Champ1Q8K327 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Champ1Q8K327 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Champ1Q8K327 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Champ1Q8K327 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Champ1Q8K327 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Champ1Q8K327 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Champ1Q8K327 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Champ1Q8K327 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Champ1Q8K327 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Champ1Q8K327 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Champ1Q8K327 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Champ1Q8K327 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Champ1Q8K327 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Champ1Q8K327 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Champ1Q8K327 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Champ1Q8K327 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Champ1Q8K327 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Champ1Q8K327 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Champ1Q8K327 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Champ1Q8K327 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Champ1Q8K327 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms