Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms