Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Cldn34c1Q8K193 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Cldn34c1Q8K193 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Cldn34c1Q8K193 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Cldn34c1Q8K193 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Cldn34c1Q8K193 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Cldn34c1Q8K193 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Cldn34c1Q8K193 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Cldn34c1Q8K193 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn34c1Q8K193 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Cldn34c1Q8K193 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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