Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mterf1aQ8CHZ9 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mterf1aQ8CHZ9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms