Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pramef8Q8CE24 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms