Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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