Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc15Q8C9M2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms