Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccser1Q8C0C4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms