Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdcl3Q8BVF2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl3Q8BVF2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms