Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca8Q8BHX3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca8Q8BHX3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca8Q8BHX3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca8Q8BHX3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca8Q8BHX3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca8Q8BHX3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca8Q8BHX3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca8Q8BHX3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca8Q8BHX3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca8Q8BHX3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca8Q8BHX3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca8Q8BHX3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca8Q8BHX3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca8Q8BHX3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca8Q8BHX3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca8Q8BHX3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca8Q8BHX3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca8Q8BHX3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca8Q8BHX3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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