Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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ChfrQ810L3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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ChfrQ810L3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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ChfrQ810L3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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ChfrQ810L3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms