Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pcsk9Q80W65 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Pcsk9Q80W65 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Pcsk9Q80W65 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Pcsk9Q80W65 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Pcsk9Q80W65 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Pcsk9Q80W65 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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