Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms