Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NischQ80TM9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
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