Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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Dsg1bQ7TSF1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Dsg1bQ7TSF1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Dsg1bQ7TSF1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Dsg1bQ7TSF1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms