Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms