Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Zbtb40Q6PCS8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms