Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
TroQ6DIC6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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TroQ6DIC6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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TroQ6DIC6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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