Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pdzrn3Q69ZS0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Pdzrn3Q69ZS0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzrn3Q69ZS0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Pdzrn3Q69ZS0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Pdzrn3Q69ZS0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzrn3Q69ZS0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Pdzrn3Q69ZS0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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