Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ric1Q69ZJ7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms