Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg9aQ68FE2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms