Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kiaa1549Q68FD9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms