Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ctnna3Q65CL1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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