Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms