Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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