Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms