Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Mkrn3Q60764 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Mkrn3Q60764 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Mkrn3Q60764 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Mkrn3Q60764 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Mkrn3Q60764 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Mkrn3Q60764 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Mkrn3Q60764 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Mkrn3Q60764 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Mkrn3Q60764 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Mkrn3Q60764 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Mkrn3Q60764 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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Mkrn3Q60764 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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