Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf354cQ571J5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms