Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ulk4Q3V129 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk4Q3V129 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms